Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930550L24RikQ99PA7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930550L24RikQ99PA7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930550L24RikQ99PA7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms