Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf2ird2Q99NI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2ird2Q99NI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2ird2Q99NI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf2ird2Q99NI3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms