Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pink1Q99MQ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pink1Q99MQ3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pink1Q99MQ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pink1Q99MQ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pink1Q99MQ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms