Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdpd3Q99LY2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdpd3Q99LY2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdpd3Q99LY2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdpd3Q99LY2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gdpd3Q99LY2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms