Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ciao1Q99KN2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ciao1Q99KN2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ciao1Q99KN2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ciao1Q99KN2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ciao1Q99KN2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ciao1Q99KN2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ciao1Q99KN2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ciao1Q99KN2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ciao1Q99KN2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ciao1Q99KN2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ciao1Q99KN2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ciao1Q99KN2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ciao1Q99KN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ciao1Q99KN2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ciao1Q99KN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ciao1Q99KN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ciao1Q99KN2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ciao1Q99KN2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ciao1Q99KN2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ciao1Q99KN2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ciao1Q99KN2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms