Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab28Q99KL7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab28Q99KL7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab28Q99KL7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab28Q99KL7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab28Q99KL7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab28Q99KL7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab28Q99KL7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms