Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK9

Hars2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hars2Q99KK9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hars2Q99KK9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hars2Q99KK9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hars2Q99KK9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hars2Q99KK9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Hars2Q99KK9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hars2Q99KK9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms