Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pls3Q99K51 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pls3Q99K51 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pls3Q99K51 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pls3Q99K51 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pls3Q99K51 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pls3Q99K51 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pls3Q99K51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pls3Q99K51 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pls3Q99K51 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pls3Q99K51 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pls3Q99K51 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pls3Q99K51 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pls3Q99K51 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pls3Q99K51 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pls3Q99K51 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pls3Q99K51 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pls3Q99K51 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms