Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TrabdQ99JY4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TrabdQ99JY4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrabdQ99JY4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TrabdQ99JY4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms