Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR6

Nmnat3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmnat3Q99JR6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nmnat3Q99JR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nmnat3Q99JR6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nmnat3Q99JR6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nmnat3Q99JR6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms