Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pacsin3Q99JB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pacsin3Q99JB8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin3Q99JB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pacsin3Q99JB8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pacsin3Q99JB8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms