Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prdm9Q96EQ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prdm9Q96EQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm9Q96EQ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm9Q96EQ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm9Q96EQ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prdm9Q96EQ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prdm9Q96EQ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms