Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc8b1Q925Q3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc8b1Q925Q3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc8b1Q925Q3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc8b1Q925Q3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc8b1Q925Q3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc8b1Q925Q3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms