Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PdgfdQ925I7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PdgfdQ925I7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PdgfdQ925I7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PdgfdQ925I7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PdgfdQ925I7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PdgfdQ925I7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PdgfdQ925I7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PdgfdQ925I7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PdgfdQ925I7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PdgfdQ925I7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PdgfdQ925I7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PdgfdQ925I7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PdgfdQ925I7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PdgfdQ925I7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms