Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Lmo1Q924W9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmo1Q924W9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Lmo1Q924W9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Lmo1Q924W9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmo1Q924W9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms