Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim59Q922Y2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim59Q922Y2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim59Q922Y2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim59Q922Y2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim59Q922Y2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim59Q922Y2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim59Q922Y2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim59Q922Y2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim59Q922Y2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim59Q922Y2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim59Q922Y2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim59Q922Y2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trim59Q922Y2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim59Q922Y2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms