Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkal1Q91WE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdkal1Q91WE6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkal1Q91WE6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkal1Q91WE6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkal1Q91WE6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkal1Q91WE6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms