Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TgdsQ8VDR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TgdsQ8VDR7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TgdsQ8VDR7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TgdsQ8VDR7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TgdsQ8VDR7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms