Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc92Q8VDN4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc92Q8VDN4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc92Q8VDN4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc92Q8VDN4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms