Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCM7

Fgg, Fibrinogen gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FggQ8VCM7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FggQ8VCM7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FggQ8VCM7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FggQ8VCM7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FggQ8VCM7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FggQ8VCM7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FggQ8VCM7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FggQ8VCM7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FggQ8VCM7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FggQ8VCM7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FggQ8VCM7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FggQ8VCM7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FggQ8VCM7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FggQ8VCM7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FggQ8VCM7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FggQ8VCM7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FggQ8VCM7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FggQ8VCM7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms