Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BbxQ8VBW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BbxQ8VBW5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BbxQ8VBW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BbxQ8VBW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BbxQ8VBW5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BbxQ8VBW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BbxQ8VBW5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms