Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TxlnbQ8VBT1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TxlnbQ8VBT1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TxlnbQ8VBT1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TxlnbQ8VBT1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TxlnbQ8VBT1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TxlnbQ8VBT1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms