Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8R3C1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q8R3C1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8R3C1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8R3C1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q8R3C1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8R3C1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8R3C1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q8R3C1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8R3C1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q8R3C1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q8R3C1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8R3C1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8R3C1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8R3C1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8R3C1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8R3C1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8R3C1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8R3C1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8R3C1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms