Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc59Q8R2N0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc59Q8R2N0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc59Q8R2N0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc59Q8R2N0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc59Q8R2N0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms