Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CcsapQ8QZT2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CcsapQ8QZT2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcsapQ8QZT2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CcsapQ8QZT2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CcsapQ8QZT2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CcsapQ8QZT2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms