Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxc12Q8K5B8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc12Q8K5B8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc12Q8K5B8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxc12Q8K5B8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxc12Q8K5B8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxc12Q8K5B8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxc12Q8K5B8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxc12Q8K5B8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms