Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rassf9Q8K342 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rassf9Q8K342 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rassf9Q8K342 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rassf9Q8K342 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rassf9Q8K342 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rassf9Q8K342 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms