Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsl1Q8K305 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsl1Q8K305 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsl1Q8K305 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nsl1Q8K305 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nsl1Q8K305 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms