Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scara5Q8K299 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scara5Q8K299 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scara5Q8K299 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scara5Q8K299 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scara5Q8K299 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scara5Q8K299 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms