Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcf3Q8K268 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcf3Q8K268 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcf3Q8K268 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcf3Q8K268 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcf3Q8K268 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms