Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFW7

Cc2d2a, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2aQ8CFW7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
Cc2d2aQ8CFW7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Cc2d2aQ8CFW7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Cc2d2aQ8CFW7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Cc2d2aQ8CFW7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Cc2d2aQ8CFW7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Cc2d2aQ8CFW7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Cc2d2aQ8CFW7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Cc2d2aQ8CFW7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Cc2d2aQ8CFW7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Cc2d2aQ8CFW7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Cc2d2aQ8CFW7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Cc2d2aQ8CFW7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Cc2d2aQ8CFW7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Cc2d2aQ8CFW7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Cc2d2aQ8CFW7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Cc2d2aQ8CFW7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Cc2d2aQ8CFW7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Cc2d2aQ8CFW7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
Cc2d2aQ8CFW7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Cc2d2aQ8CFW7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Cc2d2aQ8CFW7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Cc2d2aQ8CFW7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Cc2d2aQ8CFW7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Cc2d2aQ8CFW7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Cc2d2aQ8CFW7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Cc2d2aQ8CFW7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Cc2d2aQ8CFW7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
Cc2d2aQ8CFW7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Cc2d2aQ8CFW7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Cc2d2aQ8CFW7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms