Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ercc8Q8CFD5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ercc8Q8CFD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc8Q8CFD5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ercc8Q8CFD5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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