Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrif1Q8CDD9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrif1Q8CDD9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrif1Q8CDD9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrif1Q8CDD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrif1Q8CDD9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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