Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrn3Q8CBC6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn3Q8CBC6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn3Q8CBC6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn3Q8CBC6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn3Q8CBC6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms