Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apoa5Q8C7G5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apoa5Q8C7G5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Apoa5Q8C7G5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Apoa5Q8C7G5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa5Q8C7G5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms