Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bhlhe22Q8C6A8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bhlhe22Q8C6A8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bhlhe22Q8C6A8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms