Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0T1

Fem1ab, Protein fem-1 homolog A-B, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fem1abQ8C0T1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fem1abQ8C0T1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fem1abQ8C0T1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fem1abQ8C0T1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fem1abQ8C0T1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1abQ8C0T1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1abQ8C0T1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fem1abQ8C0T1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fem1abQ8C0T1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fem1abQ8C0T1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fem1abQ8C0T1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fem1abQ8C0T1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fem1abQ8C0T1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fem1abQ8C0T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms