Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0M8

Dnai1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnai1Q8C0M8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Dnai1Q8C0M8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Dnai1Q8C0M8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Dnai1Q8C0M8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dnai1Q8C0M8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnai1Q8C0M8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnai1Q8C0M8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnai1Q8C0M8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnai1Q8C0M8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Dnai1Q8C0M8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Dnai1Q8C0M8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Dnai1Q8C0M8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms