Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp4aQ8BU40 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4aQ8BU40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4aQ8BU40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4aQ8BU40 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4aQ8BU40 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp4aQ8BU40 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp4aQ8BU40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Nlrp4aQ8BU40 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp4aQ8BU40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp4aQ8BU40 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 359.6 ms