Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klhl38Q8BSF5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl38Q8BSF5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl38Q8BSF5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klhl38Q8BSF5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms