Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPI1

Dnaaf2, Protein kintoun, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf2Q8BPI1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Dnaaf2Q8BPI1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Dnaaf2Q8BPI1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnaaf2Q8BPI1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf2Q8BPI1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnaaf2Q8BPI1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Dnaaf2Q8BPI1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnaaf2Q8BPI1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Dnaaf2Q8BPI1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms