Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trpa1Q8BLA8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trpa1Q8BLA8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trpa1Q8BLA8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpa1Q8BLA8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpa1Q8BLA8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpa1Q8BLA8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpa1Q8BLA8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpa1Q8BLA8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms