Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nop53Q8BK35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Nop53Q8BK35 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nop53Q8BK35 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop53Q8BK35 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop53Q8BK35 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop53Q8BK35 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms