Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ56

Pnpla2, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla2Q8BJ56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnpla2Q8BJ56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnpla2Q8BJ56 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnpla2Q8BJ56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnpla2Q8BJ56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnpla2Q8BJ56 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnpla2Q8BJ56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnpla2Q8BJ56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla2Q8BJ56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla2Q8BJ56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla2Q8BJ56 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnpla2Q8BJ56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms