Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Slfnl1Q8BHW9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Slfnl1Q8BHW9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29,89■■■□□ 2,38
Slfnl1Q8BHW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29,87■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Slfnl1Q8BHW9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Slfnl1Q8BHW9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Slfnl1Q8BHW9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Slfnl1Q8BHW9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,8 ms