Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl1Q8BH66 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atl1Q8BH66 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atl1Q8BH66 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atl1Q8BH66 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atl1Q8BH66 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms