Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms