Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim6Q8BGE7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim6Q8BGE7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim6Q8BGE7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim6Q8BGE7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim6Q8BGE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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