Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt12Q8BG71 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt12Q8BG71 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt12Q8BG71 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt12Q8BG71 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt12Q8BG71 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt12Q8BG71 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt12Q8BG71 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms