Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmtc4Q8BG19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmtc4Q8BG19 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmtc4Q8BG19 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmtc4Q8BG19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc4Q8BG19 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmtc4Q8BG19 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmtc4Q8BG19 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmtc4Q8BG19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmtc4Q8BG19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmtc4Q8BG19 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms