Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Jmjd4Q8BFT6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Jmjd4Q8BFT6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Jmjd4Q8BFT6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Jmjd4Q8BFT6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Jmjd4Q8BFT6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Jmjd4Q8BFT6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Jmjd4Q8BFT6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms